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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。
全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
“中国宫灯第一村”河北屯头：盏盏红灯照亮中国年******
(新春走基层)“中国宫灯第一村”河北屯头：盏盏红灯照亮中国年
中新网石家庄1月18日电 题：“中国宫灯第一村”河北屯头：盏盏红灯照亮中国年
作者 李玉素 俱凝搏
挂红灯笼是中国春节的传统习俗，红色寓意喜庆，而圆形的灯笼寓意着团圆美满。春节临近，走进“中国宫灯第一村”——河北省石家庄市藁城区屯头村，红纱灯笼摆满道路两旁，家家户户正在赶制灯笼订单。
藁城宫灯起源于东汉，由古人用的纱罩灯衍变而来。清乾隆年间，皇帝下江南路过藁城，看见老百姓门前挂的红灯笼，外表华丽，工艺精湛，就带回宫中悬挂，故得名“宫灯”。
作为河北省级非物质文化遗产，藁城宫灯以红纱灯最为出名，其材料以竹子为骨架，通过劈、刮、打眼、穿丝等多道工艺，制成椭圆形状，外敷红色绸布制成宫灯。
图为工人赶制宫灯。 翟羽佳 摄“每年从11月份开始屯头村就进入了生产、销售灯笼的旺季，目前屯头村各类宫灯年产量达1亿对，占国内90%的市场份额。”据屯头村党支部书记白理伟介绍，近年，藁城区大力发展宫灯特色产业，逐渐形成了以屯头村为中心，辐射周边乡镇的制作与销售区域，其产品统称“藁城宫灯”。
白理伟笑说，“藁城宫灯在海外也很受欢迎，今年出口订单以越南为主，越南人也过春节，而最受欢迎的还是咱们传统的圆形红纱灯。”
随着时代发展，藁城宫灯不断在质量和品种上改进。据藁城区宫灯协会会长白会平介绍，藁城宫灯已由过去的单一品种发展到现在的转灯、羊皮灯、纸雕灯等18个系列200多个品种，造型也由过去单一的椭圆形发展到南瓜形、圆球形等多种形状。
“这款灯笼支持定制图案、文字，有需要的家人们可以看看咱们的1号链接……”走进屯头村宫灯制作大户苏云广家中，主播正通过电商平台介绍灯笼产品。
图为工人制作超大灯笼。 翟羽佳 摄随着互联网电商的发展，藁城宫灯的销售渠道从线下逐渐发展到线上。苏云广说，这几年家里一半以上的宫灯都是通过电商平台销售，电商扩宽了宫灯的销售渠道，也让这项技艺被更多人熟知。
目前，屯头村共有电商平台400余家，涵盖多个电商平台和销售网站，从业人员超过2000人，单纯电商渠道年产值超5亿元，占全部销售量的四成左右。
大红灯笼高高挂，红红火火迎新年。一盏盏红灯笼，从屯头村走向五湖四海，也让中国“年味儿”照亮海内外。(完)
（文图：赵筱尘 巫邓炎） [责编：天天中] 阅读剩余全文（）  视觉焦点
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